生殖疱疹和艾滋病在传播途径、临床表现以及治疗策略上均有所不同，两者各有难点，所以不能简单说生殖疱疹目前比艾滋病更难治。
1、病原体特性：
生殖疱疹主要由单纯疱疹病毒引起，而艾滋病则是由人类免疫缺陷病毒导致。单纯疱疹病毒在感染后会潜伏在神经细胞内，形成慢性感染，难以完全清除；而人类免疫缺陷病毒病毒则主要攻击人体的免疫系统，导致免疫功能下降甚至丧失。从病原体特性来看，两者各有难点，但人类免疫缺陷病毒病毒对免疫系统的破坏更为严重。
2、治疗策略：
生殖疱疹的治疗主要依赖于抗病毒药物，可以抑制病毒的复制，减轻症状，但难以完全清除病毒，而艾滋病的治疗则更为复杂，需要采用高效联合抗反转录病毒治疗，通过多种药物的组合来抑制病毒的复制，还要进行免疫重建治疗和支持治疗。从治疗策略来看，艾滋病的治疗更为复杂。
3、复发与预防：
生殖疱疹的明显特点是容易复发，即使经过治疗，病毒也可能在神经细胞内潜伏多年，一旦机体免疫力下降，可能会再次发作，而艾滋病的预防则更为困难，临床尚无有效的疫苗可以预防人类免疫缺陷病毒病毒的感染。从复发与预防的角度来看，生殖疱疹的复发问题更为突出。
对于这两种疾病的治疗，均需要根据患者的具体情况制定治疗方案，并积极配合医生进行随访。