男孩通常在12-16岁开始遗精，这与青春期的生理发育进程紧密相关。12岁左右，男孩下丘脑-垂体-性腺轴逐渐启动，分泌促性腺激素释放激素，刺激垂体分泌促性腺激素，进而促使睾丸发育，开始产生精子和雄性激素，为遗精奠定生理基础。
雄性激素水平在12-16岁期间快速上升，不仅促进生殖器官发育，还刺激精囊、前列腺等附属性腺生长。这些腺体开始分泌液体，与精子混合形成精液，当精液在体内积聚到一定量，就会通过遗精排出体外，这是遗精出现的物质条件。
12-16岁男孩的睾丸生精功能逐步成熟，曲细精管内的精原细胞经过一系列分裂、分化，形成成熟精子。随着精子生成量增加，精液不断积累，超过附睾和精囊的储存能力时，就会引发遗精，这是生殖系统成熟的重要标志。
青春期的神经调节机制在12-16岁时也发生变化。大脑皮层对性中枢的抑制作用逐渐减弱，使得性中枢兴奋性相对提高。当睡眠中出现性梦等刺激时，脊髓反射中枢兴奋，引发射精动作，导致遗精现象发生。
从身体发育的整体进程看，12-16岁男孩身高、体重快速增长，第二性征如阴毛、腋毛生长，喉结突出，声音变粗等明显出现。这些变化与生殖系统发育同步，共同表明身体已具备产生遗精的综合条件。此外，个体遗传因素对遗精时间有显著影响。如果家族中男性青春期发育较早，男孩受遗传基因影响，下丘脑-垂体-性腺轴启动时间也可能提前，从而较早出现遗精；反之，遗传因素则可能使遗精时间推迟。