乳酸菌素片长期服用可能会有肠道菌群失调、胃肠道不适症状，也可能会引发过敏反应，或者导致营养不良，甚至会出现中枢神经系统不良反应等危害，因此避免长期服用。
1、肠道菌群失调
乳酸菌素片可以选择性杀死肠道致病菌，保护促进有益菌的生长，但如果长期服用，可能产生药物依赖性，如果突然停药，容易导致肠道菌群失调，导致肠道内致病菌增多，出现胃痛、便秘等不良反应。
2、胃肠道不适
乳酸菌素片正常服用时一般不会有明显的胃肠道不适症状，若是长期服用，可能会对胃肠黏膜造成刺激，引起胃肠道不适，出现恶心、呕吐、腹痛等不适症状。
3、过敏反应
乳酸菌素片主要成分包括乳酸菌素，还有淀粉等辅料，如果属于易过敏体质，长期服用药物可能会导致药物成分积聚，引起过敏反应，出现皮疹、皮肤瘙痒等症状。
4、营养不良
乳酸菌素片属于药物，如果长期服用，可能会导致食欲不振，从而影响食物中营养物质的吸收，引起营养不良，对身体健康造成影响。
5、中枢神经系统不良反应
比较少见，但若长期服用，也有可能 会出现，通常表现为乏力、嗜睡等。
除此之外，还有可能会出现水肿等危害。患者存在药物适应证，需要服用乳酸菌素片时，需要按照医生建议服用，避免私自更改药物剂量，以免引发不良反应。