卵巢囊肿的危害取决于囊肿性质、大小、生长速度，多数生理性囊肿无明显危害，病理性囊肿或较大囊肿可能累及生殖健康与全身状态，需按轻重度针对性警惕。
1、轻度危害：生理性囊肿（如卵泡囊肿、黄体囊肿）多无症状，体积较小，可自行消退，仅可能在体检时发现，对健康无影响，小型病理性囊肿可能伴随轻微下腹坠胀、腰酸，不影响日常活动。
2、中度危害：囊肿体积增大（直径5-10厘米）时，可能压迫周围器官，导致尿频、尿急、腹胀、排便不适，影响卵巢功能，导致月经不调、经量增多或减少、闭经，部分患者可能影响排卵，降低受孕概率。
3、重度危害：囊肿发生扭转、破裂，引发突发性剧烈下腹疼痛，伴随恶心呕吐、发热，若不及时手术可能导致腹腔内出血、感染，危及生命，恶性囊肿（卵巢癌）会侵犯周围组织，癌细胞扩散转移，影响生存期，长期不干预的病理性囊肿，可能因反复感染、出血加重病情。
定期做妇科超声筛查，能早期区分囊肿性质，生理性囊肿定期监测即可，病理性囊肿及时治疗，可有效规避重度危害。