肛周脓肿并不一定会形成肛瘘，结果受多种因素影响，脓肿位置、感染程度、治疗方式以及个体差异都在其中起着关键作用。
1、脓肿位置：若肛周脓肿发生在肛门周围较浅部位，相对来说形成肛瘘的可能性较小，浅部脓肿通常可通过及时的切开引流得到较好的治疗效果，炎症局限，不太容易向深部组织蔓延形成复杂的瘘管，但如果处理不当，仍有一定风险发展为肛瘘。
2、感染程度：轻度的肛周脓肿，感染范围较小，炎症反应相对较轻，经过积极有效的抗感染治疗和局部处理后，一般不会形成肛瘘，若感染严重，脓液积聚较多，对周围组织的破坏较大，就很有可能在后期形成肛瘘。
3、治疗方式：及时正确的治疗方式能大大降低肛瘘形成的风险，单纯的切开引流如果不彻底，残留的感染灶可能会导致肛瘘。如果采取根治性手术，彻底清除感染源和潜在的瘘管组织，形成肛瘘的可能性就会显著降低。
4、个体差异：不同个体的身体状况和免疫功能存在差异，免疫力较强的患者，在发生肛周脓肿后，身体自身的防御机制可能会更好地控制感染，减少肛瘘形成的几率。免疫力低下的患者，感染难以控制，更容易发展成肛瘘。
保持肛周清洁卫生，避免久坐和过度劳累，饮食上要注意均衡，多吃富含膳食纤维的食物预防便秘，一旦出现肛周不适，应立即就医，切勿自行处理。