肛门两侧红肿疼痛可能由多种具体疾病引起，如肛周湿疹、痔疮、肛周脓肿等，需要引起重视，可以在医生指导下进行积极治疗。
1、肛周湿疹：可能由过敏、局部潮湿、摩擦等因素引起，会导致肛门周围皮肤红肿、瘙痒，并可能伴有疼痛。保持肛周清洁干燥，避免过度清洁和使用刺激性强的洗液，可外用具有抗炎、止痒功效的药膏治疗。
2、痔疮：是由于长期不良生活习惯、便秘、久坐久蹲等因素导致的肛门黏膜下静脉曲张或破裂形成的疾病，当痔疮脱出或受到刺激时，可引起肛门两侧红肿疼痛。保持大便通畅，避免久坐久蹲，注意饮食调节。
3、肛周脓肿：是由于肛腺阻塞感染引起的急性化脓性炎症，脓肿形成后会对周围组织产生压迫和刺激，引起肛门两侧红肿疼痛，并可能伴有发热、肛门肿胀等症状。对于脓肿未成熟的患者，可遵医嘱使用抗生素药物进行抗感染治疗，脓肿成熟后，需通过手术切开引流。
4、肛裂：是由于长期便秘、大便干结等原因导致的肛管皮肤层裂伤，裂口处受到粪便和分泌物的刺激，可引起肛门两侧红肿疼痛，并可能伴有出血。若肛裂反复发作或症状严重，则需考虑手术治疗。
5、肛瘘：是肛门直肠周围的肉芽肿性管道，通常由肛周脓肿破溃或切开引流后形成，肛瘘的外口常有分泌物排出，刺激周围皮肤引起红肿疼痛。治疗以手术为主，包括肛瘘切开术、肛瘘切除术等，术后需注意保持肛周清洁干燥，避免感染。
在出现相关症状时，建议及时就医并遵医嘱进行相应检查和治疗，平时应注意饮食清淡，避免辛辣、油腻食物，以免加重症状。