发烧眼睛疼可能是由于上呼吸道感染、 结膜炎、鼻窦炎、中耳炎、青光眼等原因导致，建议及时就医，进行相关的检查明确具体病因，并接受相应的治疗。
1、上呼吸道感染
患者受到细菌或者病毒感染后可诱发上呼吸道感染，病原体进入血液循环可刺激中枢系统并产生较多的致热原，同时炎症因子释放还可对三叉神经造成刺激而使其兴奋性增高，继而导致上述情况的发生。可以在医生指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等药物进行抗感染治疗；
2、 结膜炎
结膜表面血管和神经比较丰富，受炎症刺激可出现明显的疼痛感，病情严重时，炎性物质还会经血液循环转移至大脑，进而对体温调节中枢造成影响，引起体温异常升高，同时可伴有眼睛痛、结膜充血、眼睛瘙痒、畏光等症状。此时可以遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液等药物缓解；
3、鼻窦炎
受炎症刺激，鼻窦黏膜发生充血、肿胀，进而对三叉神经末梢造成压迫，通过神经传导转移至眼部，同时病原体在繁殖的过程中还会释放大量的热源，从而发烧时会伴有眼睛痛、鼻塞、流脓涕、头痛等症状。可遵医嘱服用鼻渊舒口服液、阿莫西林克拉维酸钾片等药物治疗；
4、中耳炎
通常是由于细菌、病毒等病原体经咽鼓管逆行感染所致，而咽鼓管又与鼻腔相通，炎症可通过咽鼓管蔓延至咽喉、鼻腔等部位，导致鼻窦等黏膜肿胀，刺激黏膜下神经，从而出现眼睛痛的症状，同时还会对人体免疫系统造成刺激，使其分泌大量的白细胞，白细胞在灭活病原体的同时会释放大量的热源，除了发烧症状外，患者还会伴有眼睛痛、耳鸣、耳痛、眩晕、眼球震颤等症状。可以使用氧氟沙星滴耳液、利福平滴耳液、氯霉素滴耳液等药物治疗；
5、青光眼
可能由遗传因素所致，在急性发作期可表现为视力模糊、眼胀等症状，严重者还可能会出现恶心呕吐、头晕、头痛等情况。若病情持续进展则会导致高烧，可在医生指导下应用硝酸毛果芸香碱滴眼液、马来酸噻吗洛尔滴眼液等药物治疗。
在治疗过程中要注意适当清淡饮食，注意避免摄入辛辣刺激性食物，如辣椒、洋葱、芥末、大蒜等，有助于恢复。