阴茎上长小疙瘩可能由多种原因引起，常见情况有尖锐湿疣、生殖器疱疹、阴茎珍珠状丘疹、龟头炎等。应及时就医，明确诊断，进行针对性治疗。
1、尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，属于性传播疾病。通常表现为阴茎上出现单个或多个散在的小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后期可逐渐增多、增大，形成乳头样、菜花样或鸡冠样的赘生物，表面湿润或粗糙不平。
2、生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染所致，也是一种性传播疾病。发病初期，阴茎上可能出现单个或群集的小水疱，疱液清亮，2～4天后破溃形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，然后结痂自愈，但容易复发。
3、阴茎珍珠状丘疹：病因尚不明确，可能与局部刺激、生理发育变异等有关。主要表现为阴茎冠状沟边缘和冠状沟处出现珍珠状、半透明的小丘疹，颜色多为白色、黄色或淡红色，沿冠状沟排列成一行或数行，互不融合，一般无自觉症状。
4、龟头炎：细菌、真菌或其他病原体感染龟头，可引起龟头炎，导致阴茎出现小疙瘩。常伴有龟头红肿、疼痛、瘙痒等症状，严重时可出现溃疡、渗液。如果是念珠菌性龟头炎，还可能看到白色豆腐渣样分泌物。
使用了某些可能引起过敏的物质，如避孕套、清洁剂、新换的内裤材质等，可能导致阴茎局部过敏，出现小疙瘩，同时伴有瘙痒、红肿等症状。严重时可能出现水疱、渗出等表现。
阴茎长了个小疙瘩的治疗方法
- 细菌感染如毛囊炎等，可使用外用抗生素类药物涂抹，保持阴茎清洁干燥，必要时可口服抗生素。若是尖锐湿疣等病毒感染，可采用物理方法如激光、冷冻去除疣体，还可使用抗病毒药物进行局部或全身治疗。对于生殖器疱疹，除了用抗病毒药物外，还需注意防止继发感染。
- 珍珠状阴茎丘疹一般无需特殊治疗，注意个人卫生，若因美观问题想去除，可采用激光等物理疗法。皮脂腺异位症通常也不需要治疗，如有需求，可考虑激光、电灼等方法。若小疙瘩是过敏引起，要远离过敏原，使用抗组胺类药物等进行抗过敏治疗。