亚香棒虫草和冬虫夏草在多个方面存在明显的区别，比如在形态结构、生长环境、显微鉴别、化学成分、气味等方面都存在显著的差异。
1.形态结构
亚香棒虫草的子座从寄主头部生出，柄白色，顶部一般灰色至灰黑色，长卵圆形至柱状，单生，二叉分枝或成簇着生，一般8-22mm×5-8mm，成熟时与柄的界限分明，无不孕顶端。而冬虫夏草的子座为一年生，棍棒状，新鲜时革质，基部浅黄色，中部黄褐色，顶部黑褐色，长可达6cm，直径可达2mm；
2.生长环境
亚香棒虫草主要生长在低海拔的半湿润草丛中，特别是林中落叶层下的鳞翅目幼虫上。而冬虫夏草则主要生长在高海拔的高山积雪、高山草甸等地带，如西藏、青海、甘肃、四川、贵州、云南等省（自治区）的高寒地带和雪山草原；
3.显微鉴别
在显微镜下观察，亚香棒的横截面呈粉末状，质地相对疏松，有轻微裂纹，有一层清晰的细菌膜未被去除。而冬虫夏草的横截面则细腻，质地坚实，大部分呈棕色丝状波纹，外层为黄色或黄褐色，有轻微光泽；
4.化学成分
亚香棒虫草含甘露醇、麦角甾醇、糖、氨基酸、生物碱及有机酸等多种成分。而冬虫夏草则是一种中药材，具有补肾益肺、止血化痰等功效，其化学成分包括多种氨基酸、肽类、核苷类、甾醇类、多糖类、维生素类及无机元素等；
5.气味
亚香棒虫草的味道偏苦且有腥味，而冬虫夏草则具有一股淡淡的菌香味和淡腥味的混合味道。
总的来说，亚香棒虫草和冬虫夏草有很多差异，而且二者在价格上也有差异。但需要注意，虽然亚香棒虫草在某些地方被用作冬虫夏草的替代品，但由于其微毒的特性，长期食用可能会出现头晕、呕吐等现象，所以要在医生指导下使用。