基底节区位于大脑半球白质内靠近底部，包括尾状核、豆状核等结构，与大脑其他结构有密切联系，在颅脑断层扫描中可通过特定标志识别，功能分区不同，其病变常致严重神经功能障碍。
- 基底节区位于大脑半球白质内，靠近大脑底部，包括尾状核、豆状核、屏状核以及杏仁体等结构。其位置相对较深，周围被众多神经纤维束和脑室所环绕，与大脑皮层、丘脑、下丘脑等结构有着密切的纤维联系。这些联系在调节运动、感觉、认知等功能方面发挥着重要作用，例如与大脑皮层的连接参与了运动的规划和执行。
- 基底节区在功能上可分为多个分区，不同分区在神经功能调节中具有不同的作用，例如尾状核头部主要参与情感和认知调节，而豆状核则更多地与运动控制相关。由于基底节区在运动和认知等功能中具有关键作用，该区域的病变如出血、梗死、肿瘤等，常导致严重的神经功能障碍，如帕金森病、舞蹈病、偏瘫等。
在颅脑的断层扫描图像（如CT、MRI）中，基底节区通常可以通过特定的解剖标志来识别，如 在冠状面上，可通过侧脑室、内囊等结构来确定其位置。