复方氯己定用了3天牙齿变黄，可能由多种因素导致，主要包括药物着色、牙齿清洁不到位、牙结石、牙菌斑等，处理措施包括洁牙、药物治疗等。
1、药物着色：复方氯己定含漱液是一种消毒防腐类药物，对于口腔内的炎症感染性疾病有较好的治疗效果。但是其中的某些成分可能会与牙齿表面的牙釉质发生反应，导致牙齿着色，出现变黄的现象。一般情况下，这种药物着色在停药后多数能够自行缓解，如果停药后牙齿发黄的情况没有明显改善，可以考虑去医院口腔科进行超声洁牙配合牙面抛光，以彻底去除牙齿表面的着色。
2、牙齿清洁不到位：复方氯己定含漱液主要用于治疗口腔炎症性疾病，而口腔炎症可能导致刷牙时出现疼痛、发酸等不适，从而影响牙齿的清洁效果。如果在使用复方氯己定期间没有保持良好的口腔卫生习惯，如刷牙不彻底或未使用合适的牙刷等，都可能导致牙齿清洁不到位，进而出现牙齿变黄的情况。建议在治疗期间及日常生活中保持良好的口腔卫生习惯，定期刷牙并使用合适的牙刷（如硅胶牙刷）进行清洁。同时，可以考虑使用牙线、冲牙器等辅助工具来加强牙齿的清洁效果。
3、牙结石：牙结石是沉积在牙齿表面已钙化的牙菌斑和软垢，长期存在会导致牙齿颜色改变。虽然这与复方氯己定的使用无直接关系，但也可能在使用期间被注意到。利用超声波仪器产生的震荡将牙齿上的结石去掉，使牙齿变得更光滑干净。
4、牙菌斑：牙菌斑是附着在牙齿表面的细菌性薄膜，如果不及时清除，也可能导致牙齿变黄。坚持早晚两次正确刷牙，可以将附着在牙齿表面的牙菌斑去除。对于较严重的牙菌斑，可在医生的指导下使用抗菌药物，如阿莫西林胶囊、头孢克肟片等。
为了改善这一情况，建议停药后观察牙齿颜色的变化，并在日常生活中保持良好的口腔卫生习惯。如果牙齿发黄的情况持续存在或加重，建议及时就医并遵循医生的建议进行治疗。