巨野县人民医院胸外泌尿外科（泌尿外科）为菏泽市重点专科，位于病房楼12层东侧。现有主任医师2名，副主任医师1名，主治医师5名，住院医师2名，研究生2名。选派业务骨干前往北京301医院、北京大学泌尿外科研究所、上海长海医院、上海瑞金医院、浙江邵逸夫医院等国家知名医院进修深造。科室配置了等离子电切镜、电子腹腔镜、输尿管硬镜及软镜、大功率钬激光碎石机、体外碎石机、莱博瑞尿动力分析仪、实时双探头双平面显示彩超机等高端设备10余台（套）。在前列腺增生、膀胱肿瘤的电切治疗，小儿鞘膜积液及隐睾的小切口微创治疗，经皮肾镜碎石取石及输尿管软镜下钬激光碎石术，腹腔镜及显微镜下精索静脉曲张高位结扎术，超声引导下前列腺穿刺活检，尿流动力学检查等技术处于全市先进水平。在泌尿外科常见病、多发病的诊治，如：肾、输尿管、膀胱的结石及肿瘤、血尿、排尿困难、尿失禁等方面拥有丰富临床经验。特别是腹腔镜下肾肿瘤根治性切除及部分切除术，腹腔镜下肾上腺切除术，腹腔镜下膀胱癌根治性切除术等高难度微创手术，取得良好效果，深受患者好评。