菏泽市立医院肝胆外科，原是普通外科的一部分，1987年1月，医院普通外科在科内设立肝胆甲状腺组和胃肠乳腺组，肝胆外科专业成立。王兆允带领韩要法、李建军、张福元、张庆忠等从事肝胆外科工作。1994年，喇华岷退休，刘德惠、李建军任普通外科副主任，1998年，李建军任普通外科主任，司世同、王柏祥任普通外科副主任。李建军、韩要法、张福元、魏志新从事肝胆外科工作，肝胆外科进入快速发展阶段，相继开展规则性肝切除、肝中叶切除术、胰十二指肠切除术、肝门部胆管癌切除、胆囊癌切除、布-加氏综合征手术治疗、肠系膜上静脉和下腔静脉分流、巨大腹膜后肿瘤切除、胰体尾肿瘤切除等手术。2006年，副主任司世同带领袁志勇、孙智勇开展医院第一例腹腔镜胆囊切除术。2011年9月，肝胆外科从普通外科分离出来，独立建科，刘云建任主任，徐晓秋任护士长。2013年7月，刘云建调离，博士叶永强任肝胆外科主任，孙智勇任副主任，护士长徐晓秋，副护士长张兰菊，肝胆外科进入快速发展新阶段。可完成胰尾状叶切除、肝右三叶切除、肝中叶切除为代表的大多数肝脏肿瘤切除手术，熟练实施包括血管切除重建在内的胰十二指肠切除术，开展肝十二指肠韧带骨骼化清扫淋巴结、合并肝叶切除的肝门部胆管癌根治、肝十二指肠韧带骨骼化清扫淋巴结、合并肝叶切除的胆囊癌根治、肝叶切除+部分尾状叶切除+门静脉切开取栓+门静脉部分切除+门静脉吻合术，脾肾分流+贲门周围血管离断治疗门静脉高压症。特别是开展一系列腹腔镜微创手术，开创了菏泽市立医院微创外科的新局面，如腹腔镜胆囊切除、胆总管切开取石、T管引流术，经腹腔镜胆囊切除、胆总管切开取石、激光碎石、T管引流、肝左外叶切除术，经腹腔镜脾切除术，经腹腔镜疝修补术，内镜下逆行胰胆管造影、十二指肠乳头切开取石术，经腹腔镜肝左叶切除手术，经腹腔镜胰腺巨大囊肿切除。至2016年6月，肝胆外科分为病房和门诊两部分，病房位于综合病房楼6楼西北角，床位设置由之前的32张到38张，有抢救室1间。有电视腹腔镜、胆道镜、激光碎石仪、冷循环射频消融治疗仪、心电监护仪、静脉液体输注泵、肠内营养输注泵、超声腹部治疗仪等设备。主要治疗肝脏、胆道、胰腺、脾脏、疝、腹腔、腹膜后等疾病，是菏泽市疑难重症治疗中心，在菏泽市乃至山东省都具有重要地位。技术开展：2012年3月，应用肠内及肠外营养成功治疗一例因腹股沟嵌顿疝术后肠瘘病人。2013年7月，开展超声引导下肝癌穿刺活检术。开展菏泽市立医院第一例经腹腔镜胆囊切除、胆总管切开取石、T管引流手术。开展超声引导下肝癌射频消融术。10月，开展菏泽市立医院第一例经腹腔镜胆囊切除、胆总管切开取石、T管引流、肝左外叶切除手术，术中应用胆道激光碎石机。2014年1月，开展经腹腔镜脾切除术。2月，开展脾肾分流术。4月，开展胆囊切除术后，胆管狭窄，行肝总管空肠吻合术。5月，治疗用介入栓塞方法成功治疗1例胆道反复出血病人。2015年7月，开展经腹腔镜疝修补术。用肝脓肿穿刺及营养支持成功治疗1例多发肝脓肿病人。11月，开展内镜下逆行胰胆管造影、十二指肠乳头切开取石术。2016年1月，用腹腔穿刺及营养支持成功治疗1例急性重症胰腺炎病人。3月开展菏泽市立医院第一例经腹腔镜肝左叶切除手术。6月，开展肝右叶胆管细胞癌行肝右叶+部分尾状叶切除、门静脉切开取栓、门静脉部分切除、门静脉吻合术。