济宁医学院附属医院兖州院区外科是手术为主要方法治疗肝脏、胆道、胰腺、胃肠、肛肠、血管疾病、甲状腺和乳房疾病，烧伤、外伤等其他疾病的临床学科，是外科系统最大的专科。一般综合性医院除外科，还有骨外科、神经外科、心胸外科、泌尿外科等。

普外科包括的疾病有：

颈部疾病：入颈部外伤、甲状腺疾病等。

乳腺疾病：如乳腺癌、乳腺增生、乳腺炎等。

周围血管疾病：如下肢静脉曲张、静脉炎等；腹壁疾病：如腹股沟疝等。

腹部急症：如外伤、腹膜炎等。

胃肠疾病：如胃肠穿孔、阑尾炎、肠梗阻、胃癌、结肠癌等。

肛肠直肠疾病：如痔、直肠癌、肛瘘等。

肝胆胰脾疾病：如肝癌、胆囊炎、胆道结石、胰腺炎、门脉高压、脾大等。

其它：如小儿腹部先天性疾病、腹膜后肿瘤等。

另外，普外科与外科基础知识的联系非常紧密，如创伤修复、烧伤、冷伤、电损伤、动物咬伤、外科感染、肿瘤休克、无菌原则、输血、体液平衡、肠内肠外营养、重要器官功能衰竭、ICU、移植、显微修复、体表肿瘤等。

外科经过几十年的不断发展，目前在鲁西南地区处在领先地位，是本院的重点专科。现有医护人员22名。其中主任医师1名，副主任医师3名，主治医师3名。开放床位70张。

近年来科室在深化改革中大力加强人才培养，不断发展科技创新，尤其是微创手术，如腹腔镜下胆囊切除术、腹腔镜直肠癌切除术、腹腔镜胆总管取石术等。

高难度手术如胰十二指肠切除术、巨大肿瘤切除术、低位直肠癌保肛根治术等，都达到了本地区先进水平。

随着医院建设的不断临近，普外科也将由现在的一个病区分为2至3个病区。如甲状腺、乳腺病区，腹部外科病区。或肝、胆胃肠病区，肛肠病区。科室专业更加细化，并继续拓展专业领域，做好人才培养工作，适时引进人才，为科室不断发展奠定基础。