济宁医学院附属医院兖州院区内科历史悠久，为兖州市综合医疗实力最强的科室，在济宁地区享有一定的知名度。近十年来，内科中青年医师茁壮成长，呈现出前所未有的好势头。正式住院床位70张，分东西两个病区，其中危重症监护病床4张。在编医师11人，其中主任医师1人，副主任医师3人，主治医师5人，医师2人，护师（士）23人。科内配有心电监护仪5台呼吸机2台；电子胃镜及其附属诊疗设备2套；纤维支气管镜2套及其附属诊疗设备；肺功能仪1台；微波治疗仪1台等先进医疗设备。目前，科室已形成以消化道疾病如：胰腺疾病、消化道肿瘤、肝脏疾病和功能性胃肠疾病为核心的多个领先研究方向，并全面开展先进的国内外有关腹痛、胃溃疡、黑色便、血便、大便习惯改变、食欲不振、胃酸、十二指肠溃疡、吐血、吞咽困难、皮肤黄染、甲乙肝炎带原体测定、肝机能异常、肝胆结石、肝硬化等消化疾病诊治新技术，取得丰硕的成果，是兖州地区消化系统危重疑难疾病的诊治中心。呼吸道疾病如：常见多发病如肺炎、上呼吸道感染、慢性支气管炎、COPD、哮喘等的诊疗；危重病如气胸、呼吸衰竭、咯血、肺栓塞等病症的诊治；疑难少见病如特发性肺纤维化、肺结节等间质性肺疾病的诊治和慢性咳嗽久治不愈的诊治。另外对内分泌疾病、血液病、肾病、农药中毒的抢救治疗也已形成了一套完善的方案。内科是一个集医疗、教学、科研于一体的临床科室。随着基础与临床医学的不断发展，内科已经成为综合性医院里不可或缺的重点科室，尤其是医院内的复杂疾病和危重症的诊断与抢救。譬如各系统疾病引起的呼吸衰竭、各基础疾病继发的肺部感染、手术科室病人术前肺功能检测及其手术风险的评估等，几乎涉及医院内所有的临床专业科室的病人。