云南结石病医院泌尿外科是云南结石病医院的品牌龙头科室，该科严格按照世界卫生组织(WHO)标准组建，不但是云南省最具影响力的泌尿结石诊疗基地之一，还是西南结石病研究院在云南省的首家技术培训基地。

目前科室拥有一支高素质的专业队伍，由《结石病科学诊疗白皮书》倡导者之一、中华全国医师委员会委员、中国医师协会泌尿外科医师分会专科成员、云南结石病医院泌尿外科学科带头人冯波教授领衔，特别引进了昆明地区首台组合式输尿管软镜、高功率钬激光手术系统及EMS超声碎石系统等 领先设备。

科室以《泌尿外科诊治指南》为核心，以《临床流程》为规范，对肾结石、输尿管结石、膀胱结石、尿道结石、肾囊肿等泌尿外科疾病进行规范诊治，主要开展各类泌尿外科微创手术，包括纤维软性肾镜碎石碎石术、微创经皮肾镜碎石碎石术、输尿管镜下碎石术、 膀胱镜下碎石术等各类保肾碎石手术，无论从开展时间、技术娴熟程度及诊治病例例数方面，在云南地区均处于领先地位，为广大患者的肾脏健康保驾护航。