济南市第二人民医院眼科为医院的龙头专业，共分白内障、眼底病、角膜病、青光眼、激光、眶肿瘤、眼肌病、眼外伤八大专业和验光复光配镜中心、近视眼激光治疗中心两大中心，拥有床位140张，年门诊量80000人，手术4000多例，患者除来自山东省外，还有来自全国各地的患者。济南市第二人民医院引进大批国内外先进医疗设备60余台件，如眼底激光扫描仪（SLO）、相干眼底断层扫描仪（OCT）、准分子激光等，为眼科病人的诊断、治疗、手术提供了可靠的保证。医院实施“科技兴医、科技兴院”发展战略，各项科研成果达国际先进或领先水平，成为济南市唯一一个科技进步一等奖“三连冠”单位，近十年获科研成果奖三十余项，其中国家级1项，省级科技进步奖14项，市级科技进步奖20项。为扩大国际间交流，引进国际先进技术，派人国外研修，邀请国内外专家来院讲学和手术交流，并与国际奥比斯（ORBIS）眼科飞机医院建立了合作和学术交流关系。目前济南市第二人民医院已成为山东省规模最大、设备最先进、人才最多、专业分工最细、技术一流的专业队伍。