上海交通大学医学院附属仁济医院胆胰外科创建于2013年10月，其前身为仁济医院普外科胆道专业组，我国著名外科学专家兰锡纯教授、邝耀麟教授、施维锦教授、王平治教授、张柏根教授、陈治平教授、吴志勇教授、曹晖教授等在此领域做出了杰出贡献，为胆胰外科的创建奠定了良好基础。目前胆胰外科是国家临床重点专科，上海胆道疾病会诊中心，上海交通大学医学院胆道疾病诊治中心，上海交通大学医学院胰腺疾病诊治中心成员单位，仁济医院的重点学科与特色学科，以及上海交通大学医学院胆道疾病研究所（仁济）、上海市肿瘤系统调控与转化重点实验室(筹)所在地。仁济医院胆胰外科拥有一支技术全面的外科队伍，熟练掌握现代外科的开腹手术、腔镜微创手术、机器人手术、内镜手术等多元技术，对标国内一流水平，学科影响力逐步提升。建科以来，年门诊量、出院人数、手术人数、重点病种和重点手术例数逐年上升，成熟开展各种胆胰疾病超大型和复杂手术，特别在胰腺肿瘤、胆道肿瘤的规范化治疗方面成绩卓然，每年胆胰肿瘤治愈例数600余例。仁济医院胆胰外科在国内率先倡导“胰头癌全系膜切除”理念，使更多患者获得了根治性手术的机会，提高了R0切除率和五年生存率；提出胰腺癌肝转移的系列治疗策略，改善了这部分病人的整体治疗效果；较早提出肝内胆管癌解剖性肝切除与肝门部淋巴结清扫的治疗理念，取得了较好的治疗效果；在国内外率先进行和完善了胆囊癌根治性切除的诸多手术方式，填补了数项治疗理念的国际空白。此外，仁济医院胆胰外科还针对胆囊癌患者ErbB信号通路突变开展个体化治疗研究，并通过已建立的胆囊癌生物样本库，在不增加不良反应的基础上有效延长了胆囊癌患者生存期，是基础研究转化临床实践的典范之一。胆胰外科拥有国内一流的内镜和腔镜技术，利用腹腔镜、胆道镜和十二指肠镜对肝外胆道结石进行微创治疗；经皮经肝胆道穿刺(PTC)；逆行胰胆管造影(ERCP)；经皮经肝胆囊穿刺引流(PTGBD)；经窦道胆道介入治疗；单孔腹腔镜胆囊切除。另外，胆胰外科还开展腹腔镜/机器人下胰十二指肠切除术、胰体尾切除术、脾切除术、肝部分切除术和各类腹壁疝修补术等（如腹股沟疝、切口疝、造口旁疝等），微创手术量达到胆胰外科手术总量60%以上。仁济医院胆胰外科通过快速康复理念和日间手术相结合，遵循“快速、精准和微创”的理念，每年完成日间手术4000例，其中腹腔镜胆囊切除、疝修补术以及ERCP量占日间手术总量80%以上，极大地缩短了住院时间，减少了住院费用。胆胰外科现形成胆道肿瘤和胰腺肿瘤系列科研方向，在国际上率先成功构建胆囊癌动物和细胞模型和首次构建胆囊癌突变谱，以及在国际上首开胆囊癌靶向治疗的先河。同时建立了临床标本库和数据库，开展了三维可视化在胆道肿瘤围手术期的应用、胰腺全系膜切除的临床应用、晚期胰腺癌的转化治疗、肝内胆管癌肝门部淋巴结清扫的策略、胆囊癌根治性切除范围的研究以及胆结石的代谢成因研究等各项临床研究。建科以来，承担课题60余项，其中国家级31项，省部级13项；发表SCI论文100余篇。目前胆胰外科东院区47张床位，以胆胰和腹壁疝疾病为主，包括各类胆道疾病（胆囊及肝内外胆管结石、胆总管囊肿、胆囊癌、胆管及壶腹部癌等）、胰腺疾病（胰腺囊肿、胰腺内分泌肿瘤、胰腺癌等）及各类腹股沟疝、切口疝等；西院区24张床位，以腹膜后肿瘤及腹壁外科疾病为主，包括脂肪肉瘤、平滑肌肉瘤、恶性间皮瘤及各类腹股沟疝、切口疝、食管裂孔疝等；南院区51张床位，收治各类普外科疾病，包括肝胆胰良恶性疾病，胃、小肠及结直肠肿瘤，甲状腺及乳腺良恶性肿瘤、各类腹壁疝以及伤口愈合不良等。胆胰外科现有在编临床医师45人，其中高级职称26人，博士生导师2人，硕士生导师9人。