学院附属医院是莆田市医学会神经病学分会挂靠单位，神经内科是市级临床重点专科、省级临床重点专科建设单位，是国家级住院医师规范化培训基地，现有医生25名，其中主任医师6名，副主任医师10名，硕博士占88%。设有普通病区2个和神经重症监护病区1个，床位120张，年门诊量超过88000人次，年出院量超5400人次。 科室分为8个亚专科学组，提供包括癫痫、帕金森病、认知障碍、卒中筛查等在内的专病门诊服务，在脑血管病、癫痫、周围神经病、脱髓鞘疾病、颅内感染诊治等方面积累了丰富的临床经验。在高级卒中中心建设方面，科室排名稳居全国200名至300名之间，6小时内缺血性脑卒中再通率达60%以上（国家标准为45%），能够开展全脑造影术、急诊动脉取栓、脑血管支架植入术等手术，对脑血管病的急诊救治处于全市领先地位。 科室学术风气渐浓厚，近5年省自然科研立项5项，发表SCI论文15篇。目前正开展的新技术新项目还有：视频脑电图检查、TCD发泡试验、肉毒毒素治疗、DBS术后程控、肌电图运动单位计数技术、神经心理量表与P50检测、神经肌肉活检等。共建卒中、癫痫等专科联盟单位30家。