厦门中医院康复医学科秉承"中西并重、突出中医特色康复"的发展理念。传承陈应龙老院长学术思想并发展创新，不断学习新技术、新知识，与现代康复医学紧密结合，成为闽南地区富有盛名的中西医结合康复医学科，目前为中国康复医学会手功能康复专科培训基地，厦门市康复医学会吞咽康复分会主委单位。2021年4月18日，签约复旦大学附属华山医院康复医学科贾杰教授名医工作室，借助名院名科，携手发展。康复医学科技术力量雄厚，拥有主任医师1名、副主任医师1名、主治医师4名、住院医师1名，其中博士1人，硕士6人，康复专科护理人员3人。康复医学科长期负责本院及外院重症医学科，神经外科，神经内科的会诊任务，是区域重症、疑难神经康复诊治中心，在厦门市康复界率先开展吞咽造影、球囊扩张、间歇鼻饲、超声引导下肉毒素注射等康复技术。科室拥有现代康复及中医康复设备，包括经颅磁刺激仪、经颅直流电刺激仪、Moto-Med下肢运动系统、上肢智能训练系统、膈肌起搏电刺激仪、四肢联动训练仪台、呼吸机、吞咽障碍治疗仪、超声治疗仪、气压治疗仪、震动排痰仪、电动起立床、神经肌肉电刺激仪、低频抗痉挛治疗仪、中频脉冲治疗仪、超短波治疗仪、电针治疗仪、中药熏蒸仪、智能艾灸仪、经络治疗仪等。2009年至今，该科连续多年承担福建省科技厅、福建省卫生厅、厦门市科技局、福建中医药大学、厦门市中医院等各类课题，并以中国康复研究院、复旦大学附属华山医院、中山大学附属第三医院、天津中医药大学附属第一医院、福建省人民医院等学术机构建立了广泛稳定的学术交流，目前有多项在研课题。教学方面，科室金海鹏获得2018年北京中医药大学临床讲课高级组二等奖，庄璇获得福建中医药大学临床讲课三等奖。未来厦门市中医院康复医学科努力成为区域中西医结合康复牵头单位，积极发展亚专科康复，做大做强"吞咽康复"、"认知康复"、"手功能康复"、"重症康复"等。康复医学科主诊范围：（一）神经康复：脑卒中，脑外伤，脑肿瘤术后，各种疾病所致的吞咽障碍，脊髓损伤、认知障碍等康复。（二）重症康复：ICU获得性肌无力，呼吸机脱机困难，气管切开拔管，围手术期康复。（三）手功能康复：脑中风后上肢功能障碍、肩关节炎、乳腺癌术后淋巴水肿。（四）骨科康复：膝关节交叉韧带损伤、半月板损伤，髋关节置换术后，四肢骨折，骨质疏松症康复。