厦门大学附属第一医院感染性疾病科自2006年成立起，作为厦门市公共卫生应急中心，不断扩大病房，完善科内硬件及软件设施建设。2020年7月25日，病房搬迁至8号楼14楼，新病房增加床位57张，截至目前，包括我院杏林分院感染科的40张床位，感染性疾病科病房床位总数已接近百张。
厦门市卫计委于2012年起指定我院为艾滋病定点救治医院，并给予政策倾斜及经费支持，将艾滋病全程化管理作为科室建设一大目标，控制艾滋病的传播，延长生存时间，改善生活质量；此外，在医院的支持下，我科成为厦门市感染性疾病质控中心挂靠单位，带动厦门市各医院感染性疾病科，做好传染病管理，提高全市感染性疾病诊疗水平。2022年3月我科正式成为第二批福建省重点专科，提升了我科在厦门乃至闽西南地区的影响力。
在硬件设备方面，我科目前拥有Fibroscan、呼吸机、optiflow流量仪、血浆置换机、高敏HBVDNA检测仪、CD4检测仪等设备，以满足临床及科研需求。此外，为不断提高临床水平，培养骨干人才，医院每年选派人员前往国内顶尖感染性疾病科进行交流学习。
随着感染性疾病科的不断发展壮大，我科逐步建设亚专科，包括发热、病毒性肝炎/肝病、艾滋病、细菌真菌感染病等多个亚专科，培养亚专科人才，提高诊疗水平、提高科研能力。
（1）发热
发热亚专科目前包括主任医师2名，副主任医师3名，主治医师2名，住院医师2名，有博士1名，其余为硕士，抗感染临床药师1名。自2011年以来，共选派5名医护人员赴复旦大学附属华山医院、仁济医院等地进修学习。与风湿科、免疫科、内分泌科、急诊科、PET、肿瘤内科、肝胆胰外科等专科建立MDT协作体系，成为本地区疑难肝病、发热的领军科室，同时与上海华山建立疑难病例的转诊体系。
（2）病毒性肝炎/肝病亚专科
病毒性肝炎/肝病亚专科目前有主任医师4名，副主任医师3名、主治医师2名、住院医师1名，其中2人拥有博士学历，其余拥有硕士学历，形成老中青梯队与特色专科相适应的学科队伍，专科队伍注重人才培养。亚专科年门诊量5万余人次、住院患者年1500余人，病种涵盖病毒性、药物性、酒精性、脂肪性、自身免疫性、遗传代谢性等各种病因导致的肝炎、肝硬化、肝癌。
开展肝穿刺活检及病理组化检查、慢性病毒性肝炎的规范化个体化治疗、慢性乙型肝炎RGT治疗、乙型肝炎病毒基因分型和耐药基因检测、HBV血清标志物定量检测、肝衰竭内科综合治疗、肝病患者医院感染综合防控等多项特色技术，重型肝炎（肝衰竭）的综合抢救成功率达80%，达国内先进水平。
同时和厦门大学附属翔安医院肝移植科建立紧密联系，为终末期肝病肝移植治疗建议无缝衔接体系。我科病毒性肝炎/肝病亚专科拥有人工肝肾治疗系统，可进行血浆置换和CRRT治疗。
（3）艾滋病亚专科
艾滋病亚专科团队力量雄厚，包括主任医师3名，主治技师1名，副主任医师2名，主治医师2名，住院医师1名，其中有5位医师参加过广州八院的艾滋病泛珠青年学院，有抗感染临床药师1名，为艾滋病患者的安全用药提供更多保障。
感染性疾病科潘业主任为福建省医学会感染病学分会艾滋病学组副组长。积极参加学术交流，扩大品牌影响力，自2020年以来，亚专科团队共举办2项市级继续教育项目：2020年400余人参会，专业涵盖感染、临床微生物、呼吸和临床药学等；2021年因疫情转为线上会议，超4万人次在线参会。本院积极投身公益，每年世界艾滋病日团队与疾控、市区各大高校合作，举行艾滋病宣传及义诊活动，取得了良好的社会效益。我科在省内较早开展艾滋病治疗工作，在我市医疗机构内率先开设艾滋病专科门诊，目前仅定期随访治疗病人达3000余人，相关制度完善、流程规范、疗效较好，开展艾滋病病人“四免一关怀”活动，基本实现3个“90”目标，助力本地区艾滋病防控。
团队自成立以来，致力于疑难/危重症艾滋病及机会性感染诊治平台的建设，积极与检验科、微生物室、影像科、药剂科等相关科室协作，开展T、B淋巴细胞亚群监测，为艾滋病患者HARRT临床疗效判定提供技术判定依据；团队年收治艾滋病/相关机会性感染病例逐年增加，如艾滋病并卡氏肺孢子菌肺炎、肺部腹腔结核、结核性脑膜脑炎、肺结核、播散性非结核分枝杆菌病、肺部真菌感染、隐球菌性脑膜炎、马尔尼非青霉菌病、脓毒血症等感染性疾病，以及淋巴瘤、肺部恶性肿瘤、卡波西肉瘤等，诊断及治疗及时，疗效好。
同广州八院，华山医院建议良好的双向转诊机制。我科给予艾滋病患者及家属提供孕妇产前、产时及产后服务等综合干预措施，大大减少了艾滋病母婴传播。
（4）细菌真菌感染病亚专科
细菌真菌感染病亚专科有博士1名，硕士4名，抗感染临床药师1名。自2011年以来，共选派5名医护人员赴复旦大学附属华山医院、仁济医院等地进修学习。近3年来发热待查及细菌真菌感染病收治人数增长迅速，涵盖呼吸系统、中枢神经系统、泌尿系统、腹腔、血流感染及不明原因发热等疑难危重感染病。亚专科组建了抗感染多学科诊疗（MDT）团队，每年院内外会诊约2600余次。
科室主任兼任市感染性疾病质控中心主任，通过质控督导提高厦门市感染性疾病专业的微生物学送检率，特别是微生物二代测序的推广，以及DDD的控制。