厦门大学附属第一医院小儿普外科始建于20世纪70年代，2003年2月28日正式独立建科。目前小儿普外科医师10人（主任医师3人、副主任医师5人、主治医师2人；博士2人、硕士6人），护士18人（主任护师1人、副主任护师3人、主管护师8人、护师6人）。核定编制床位45张，病房条件良好，有关设备齐全。目前有全国最高档的螺旋CT、空气灌肠肠套叠复位机、新生儿呼吸机、多功能床边监护仪、电脑输液泵、电脑多功能早产儿培养箱、敞开式新生儿多功能抢救台、立式石英加热器等。该科目前开展的诊疗项目涵盖了小儿普外科、新生小儿普外科、小儿胸外科、小儿泌尿外科、小儿肿瘤外科、小儿微创外科等领域。开展小儿腹腔镜、胸腔镜、膀胱镜相关手术。目前科室有多套小儿专用腔镜手术器械：进口小儿肛肠测压、尿动力及生物反馈治疗仪1台，可行小儿肛门直肠测压及尿流动力学检查和肛门疾病的生物反馈治疗；钬激光1台，可行泌尿系畸形、结石的相关治疗。该科苏毅主任兼任厦门市医学会小小儿普外科分会主任委员、福建省医师协会小小儿普外科分会常委等职。杨振宇主任兼任中华妇幼外科协会常务委员、《临床小小儿普外科》杂志编委等职；许淑君护士长为厦门市医学会儿外分会小儿护理学组组长。该科为福建省三大小儿普外科住培基地之一，与上海、北京的小儿普外科及四川大学华西医院，齐鲁大学医院小儿普外科有密切联系，常获知名专家的技术指导，已开展的多种手术填补该省、市小儿普外科空白。自2020年9月起，厦门市卫生健康委员会特聘国家级教授、博士生导师、国内外小儿微创外科权威专家、享受国务院特殊津贴的李索林教授为该院小儿普外科特聘双主任，对提升该科复杂疑难疾病诊治能力具有重大意义。