福州肺科医院中医科成立于建院初始，创科人关佑民是福建省名老中医，清代御医关幼康之子，擅长肺瘘、肺痈、血症的诊疗。经过七十多年的发展，科室发展成为以治疗慢性阻塞性肺疾病、哮喘、间质性肺病等慢性气道疾病以及肺部肿瘤康复为主要特色的中医、中西医结合的临床科室，耐多药结核、非结核分枝杆菌肺病方面的诊疗亦颇具特色，设中医科门诊、中医儿科门诊、针灸推拿门诊、呼吸康复门诊和智能中药房。科室诊疗特色是中医药扶正抗癌治疗肺部肿瘤，运用中西医结合诊治方法改善肺癌患者的生存期和生活质量：肺癌术后中医药早期干预，促进术后恢复；分阶段治疗，预防复发和转移；中医药联合化放疗序贯治疗减毒增效；中医药联合靶向治疗减少副作用。同时，开展多项中医特色诊疗项目：穴位敷贴、穴位注射治疗慢性呼吸道疾病；中药外敷治疗化疗后便秘；督灸联合中药改善患者化疗毒副反应；耳穴压丸改善睡眠；针刺镇痛减轻癌性疼痛；穴位注射预防化疗后骨髓抑制、改善癌性疲劳、调节免疫功能；中医定向透药改善化疗期间消化道副反应；采用各种针灸手段辅以中西医药物治疗的综合诊治等。2022年，科室组建呼吸康复团队，引进欧美及香港现代康复技术与模式，以学科交叉为特色，发展呼吸康复亚专科，开展危重症患者的康复治疗，涵括呼吸肌锻炼和全身性运动训练、营养干预和心理社会支持等各个方面，形成以专科为方向、专病为核心、专项技术为手段的特色康复治疗。