福建医科大学附属福州市第一医院针灸科创建于1955年，集临床医疗、教学、科研于一体，门诊有3个诊室，19张治疗床。科室现有主任医师1名、主治医师2名、住院医师1名、护士1名，其中硕士研究生3名。针灸科主要承担门诊诊疗工作，并承担福建医科大学及福建中医药大学的临床实习教学工作，为福州市针灸学会挂靠单位。

针灸科注重科研研究，承担有福州市科技局课题2项，福建省卫生厅青年科研课题1项。针灸科从2006年开始开展“三伏灸和三九贴”的天灸疗法。天灸疗法的主要适应症有：过敏性鼻炎、慢性咳嗽、哮喘、慢性支气管炎、肺气肿、虚人感冒、慢性胃炎，慢性结肠炎、痛经等。