福建医科大学附属福州市第一医院心胸外科系建院初期成立，是一个医疗技术力量雄厚、现代医疗设备齐全的科室，该科从创立以来致力于胸腔疾病的临床诊治、教学和科研等方面的工作，为我省胸外科事业的普及、发展和提高作出了自己的贡献。

科室同时开展了血管外科一系列重大项目，包括人造血管内支架植入术治疗胸腹主动脉瘤、假性动脉瘤、夹层主动脉瘤、导管溶栓治疗动静脉血栓等。近年来，科室也开展一系列肿瘤介入治疗项目，包括良恶性肿瘤供血动脉的药物灌注与栓塞、肿瘤压迫腔道后所致腔道梗阻的治疗，主要病种包括肺癌、肝癌、食道癌等。