厦门大学附属福州第二医院儿科历史悠久，集临床、教学和科研为一体。主要收治小儿呼吸、心血管、神经、消化、内分泌、肾脏病等专业的各种疑难危重病例。开展儿童保健及智力筛查工作，全面系统地评价小儿体格和智能发育状况；开展手足口病防治诊治，食源性疾病感染监测，禽流感、流感、麻疹监测等公共卫生工作；开展多导视频脑电睡眠测试、小儿肺功能测试、小儿纤支镜等检查项目。

承担厦门大学医学院、福建医科大学、福建中医药大学、福建高等医学专科学校等各类院校的教学及临床带教工作。