厦门大学附属福州第二医院心胸外科于2009年独立成科，科室现拥有床位26张，医生9人（硕士学位5人），分2个医疗组，其中正高级职称1名，副高级职称3名，中级职称5名。全科多人在省，市各级学会担任常委，委员。目前常规开展的手术包括：1、胸部创伤手术（胸肋骨骨折，创伤性血气胸，膈疝，心包填塞等）；2、VATS肺癌根治术（含肺叶切除，肺段切除），自发性气胸等良性肺疾病的手术治疗；3、VATS食管癌根治术，贲门癌根治术；4、VATS纵隔肿瘤切除术；5、漏斗胸，鸡胸的NUSS及反NUSS手术，Wang手术；6、胸壁肿瘤的切除及重建手术；7、手汗症；8、脓胸，肺脓肿，严重的胸壁感染的外科手术治疗。特色诊疗科室对严重胸部创伤病人的外科治疗经验丰富，治疗例数位居全省前列。同时本中心是中国胸部创伤临床研究协作组CCIRS福建省唯一参与单位，参与制定《胸部创伤静脉血栓栓塞症诊治及预防中国专家共识》（2022版）。2022年我科门急诊量达8000余人次，住院患者550余人次，年手术量近四百台。教学、科研科室目前承担1项省自然科研项目，2项福州市级科研项目，同时作为我院外科医师规培基地承担教学任务。