福建医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科是福建省呼吸疾病临床重点专科，全国首批PCCM（呼吸与危重症医学科）规范化建设三级医院优秀单位，中国医师协会首批PCCM专科医师规范化培训基地，首批PCCM专科规范化进修基地及睡眠呼吸疾病、肺功能检查单项规范化进修基地，国家药物临床试验专业机构。呼吸与危重症医学科是国家呼吸临床研究中心核心单位、分中心；慢性阻塞性肺疾病/支气管哮喘疾病规范管理项目示范单位；“自由呼吸中国行”项目定点医院；全国肺功能检查规范化培训单位；中华护理学会呼吸专科护士京外临床教学基地；福建医科大学呼吸系病研究所、福建省睡眠呼吸疾病诊治中心挂靠单位。同时也是福建省福建医科大学医学博士、硕士培养点；福建省护理学会呼吸专科护士临床教学基地。连续6年荣获复旦专科声誉排行版（华东区）提名。2020年获得中国医师协会评选的“人文爱心科室”。科室拥有一支高素质的人才队伍，现有主任医师4人，副主任医师6人，教授4人，副教授3人，博士生导师4人，硕士生导师7人。设有呼吸重症监护病房（RICU）、肺功能室、支气管镜室、睡眠呼吸疾病诊治病房、内科胸腔镜室，同时开展肺小结节多学科诊疗门诊及睡眠呼吸疾病、肺血管疾病、慢性咳嗽、过敏性疾病、间质性肺疾病等专病门诊，在睡眠呼吸障碍性疾病、肺血管疾病、慢性气道疾病、间质性肺疾病、呼吸危重症等疾病的医疗水平位列省内前茅。科室在睡眠呼吸障碍性疾病、肺血管疾病、慢性气道疾病及间质性肺疾病的临床及基础研究，取得了一系列的原创性成果。近5年科室先后承担国家自然科学基金项目、中华医学会国际交流基金会项目、中华医学会科研项目及福建省自然科研基金及全国多个合作科研项目等30余项。发表论文300多篇，被SCI收录60余篇，获得福建省科技进步奖二等奖2项、福建省科技进步奖三等奖1项，福建医学科技奖二等奖5项。