赣南医学院第一附属医院眼科是江西省高校十五及十一五重点学科，江西省研究型医院学会高质量视觉专业委员会主委单位，赣州市医学会眼科专业委员会主委单位，赣州市医学领先专业，赣州市眼科质量控制中心挂靠单位，赣南医学院第六届重点学科，中国与澳大利亚霍洛基金会“中澳白内障合作项目”牵头单位，中澳防盲项目赣州市白内障复明手术培训中心和赣州市低视力康复指导中心。学科先后获得了国务院残疾人工作协调委员会、民政部、教育部、卫生部等七部委联合授予的“全国残疾人康复工作先进集体”，江西省“光明·微笑”工程先进集体，以及省卫生厅、澳大利亚霍洛基金会联合授予的“白内障复明手术先进集体”等荣誉称号。是赣州市儿童青少年近视防控中心挂靠单位，是江西省首家“光明中心”及“光明中心指导中心”、国家眼部疾病临床医学研究中心的“糖尿病视网膜病变临床及研究中心”之一。学科拥有一支团结进取、结构合理的高水平学术队伍，现有眼科专业技术人员31人，高级职称专业技术人员10人，硕士20余人，多年来已形成了青光眼、白内障、眼底病、小儿眼病四个相对稳定、特色明显的研究方向。其中，眼底病视网膜脱离诊治方面在省内具有领先地位，复杂视网膜脱离外路手术领域取得良好效果，达省内领先；玻璃体切割手术量常年稳居市内第一。在赣南最早成立小儿眼病方向，开展的儿童复杂微创斜视矫正术及微创泪道手术在全省处于领先地位。开展超声乳化白内障摘除人工晶体植入术、玻璃体切割术、视网膜脱离复位术、复合小梁切除术、难治性青光眼手术、角膜移植术、羊膜移植术、深部眼眶肿瘤切除术、眼眶成形、上睑下垂矫正术、眼睑再造等复杂整形手术、准分子激光原位角膜磨镶术、复杂性斜视手术、眼内异物取出术、鼻内窥镜下鼻腔泪囊吻合术、泪小管微创吻合术、复杂眼外伤联合手术等。学科配备了白内障超声乳化仪、玻璃体切割机、光学相干断层扫描血管成像、早产儿视网膜病变筛查广域成像系统、鼻内窥镜系统等一系列先进的手术治疗和检查设备。精湛的诊疗技术、先进的医疗设备和优质的服务使科室年门诊量、住院病人数和手术病人数均处于省内前列。在服务区域内眼病患者的同时为大量基层转诊的疑难性和复杂性眼病患者提供了高质量诊疗服务，为广大百姓眼病防治做出了贡献。成立赣南医学院眼科学研究所，开展眼科基础及临床科学研究。主持承担了国家自然科学基金3项、省自然科学基金4项、赣南油茶产业开发协同创新项目1项、省教育厅10项、省卫生厅20项和市科技局项目30余项。七项研究成果分别达到“省内领先、国内先进水平”，分别获得江西省科技进步三等奖1项，赣州市科技进步二等奖1项、三等奖2项。近五年发表专业学术论文100余篇，其中SCI收录10篇，EI收录7篇，核心期刊50多篇。主办了2次江西省研究型医院学会眼科学专业委员会学术会议、10次赣州市医学会眼科专科分会的学术交流大会；承办了江西省首届“天下赣医”眼科论坛暨江西省医学会眼科学分会第十五次眼科学术会议及2次江西省中西医结合眼科年会。举办了3次国家级继续医学教育项目、8次省级继续医学教育项目；举办了3次眼科新技术（玻璃体切割手术2次、视网膜脱离外路手术1次）培训班；不定期的举行各类专题学术讲座。