江西省儿童医院血液科是江西省儿童急性白血病免费救治定点单位，江西省儿童血液病质控中心挂靠单位，同时也是中华骨髓库造血干细胞移植/采集定点医院，中国罕见病联盟江西省儿童医院血友病诊疗管理中心，噬血细胞综合征中国专家联盟副理事长单位。血液科成立于1974年，为我省唯一一个小儿血液肿瘤重点临床专业科室，也是全国成立较早的专业科室之一。包含有医护人员70余人，开放床位130余张，其中百级层流病房四个单元，8张千级层流病床。设立血液一科（移植病房）和血液二科。科室技术力量雄厚，拥有技术精湛、爱岗敬业、乐于奉献、学术水平较高的优秀团队。现有小儿血液专科医师20名，其中主任医师5名、副主任医师5名、主治医师10名。在20名专科医师中，有17人具有硕士研究生学历，博士1名。多名医师在香港中文科技大学附属威尔斯亲王医院、加拿大卡尔加里大学、美国及北京、上海、天津血液中心进修，该科同时具备较高小儿血液病护理水平，有多名护士在上海、北京进修小儿血液病护理。科室积极开展小儿血液肿瘤的科研工作，以科研推动学科发展，开展各级课题研究45个，发表中外论文100多篇，获得省卫生厅科技成果二等奖2次，省科技成果三等奖1次。在完成这些科研工作的过程中，带动了血液实验工作的全面开展，建立了检测项目齐全的血液实验室，为小儿血液肿瘤的正确诊断和有效治疗奠定了坚实基础。能开展的小儿血液肿瘤疾病的检测项目有：骨髓细胞涂片检查，骨髓病理活检，白血病、淋巴瘤及各种儿童实体肿瘤的染色体及融合基因检测；用流引式细胞仪对骨髓细胞、肿瘤组织及外周血细胞进行分析（包括白血病的免疫分型、微小残病病监测、T细胞亚群测定）；各种细胞因子测定，血红蛋白分析及地中海贫血的基因诊断，出凝血疾病的筛查和凝血因子活性测定及儿童实体肿瘤的分型分期病理诊断。科室拥有优秀的专业团队和完备的小儿血液肿瘤实验室检查，能熟练精准诊治儿童白血病、儿童造血干细胞移植、淋巴瘤、肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、睾丸肿瘤、卵巢肿瘤、横纹肌肉瘤、胸腔肿瘤、脑肿瘤、再生障碍性贫血、免疫性血小板减少性紫癜、朗格罕组织细胞增生症、噬血细胞综合征、缺铁性贫血、溶血性贫血、地中海贫血、蚕豆病、血友病、出血性疾病及白细胞异常等各种血液肿瘤疑难疾病。该科同时为全省儿童白血病定点免费救助科室、浙江省壹＋壹基金会儿童实体肿瘤定点援助科室、中华慈善总会血友病定点援助科室、北京天使妈妈基金会地中海贫血及骨髓移植定点援助科室。