安徽医科大学附属巢湖医院消化内科是国家住院医师规范化培训基地、安徽医科大学消化内科专业硕士点。全科拥有专业卫生技术人员30余人，医师15名，其中主任医师2名，副主任医师7名，主治医师3名，住院医师3名。(其中硕士生导师3人)。拥有14名护理人员，其中副主任护师1名，主管护师6名。消化内科下设专科门诊、医技中心（消化内镜中心、幽门螺杆菌监测中心）以及功能性胃肠病门诊。目前开展多种内镜诊疗技术，包括：1.消化道早癌早诊早治；2.内镜粘膜下剥离术（ESD）；3.贲门失弛缓症内镜下肌切开术（POEM）；4.食管胃底静脉曲张套扎、组织胶+硬化剂注射术；5.消化道出血急诊止血；6.超声内镜；7.十二指肠乳头括约肌切开术、胆总管结石取石术、胆管内支架置入术；8.内镜下粘膜切除术（EMR）；9.消化道息肉、粘膜下肿瘤切除术；10.消化道异物取出术；11.消化道狭窄扩张、支架置入术；12.胃肠营养管置入术等。科室形成多项亚专业治疗组，分为消化道早癌筛查ESD治疗组；肝硬化门脉高压治疗组；超声内镜及胆胰疾病治疗组，每个亚专业均有经验丰富的专家作为组长。科室注重发展消化道危重症，诸如消化道大出血、炎症性肠病、急性胰腺炎等。并根据各亚专业开设胃食管反流病、功能性胃肠病以及早癌筛查门诊。