安徽医科大学第二附属医院眼科是医院重点发展专科，安徽省眼科学硕士学位和临床医学博士学位授予点，博士后流动站合作科室，安徽省医学会眼科学分会候任主委单位。包括两个住院病区、眼科门诊和屈光手术中心，目前开设标准床位66张，年住院病人6200人次，年住院手术6400台次，年门诊量约10万人次。现有医护人员47人，其中博士10人，在读博士6人，正高职称3人，副高职称7人。博士生导师1人，硕士生导师8人，学科现有“江淮名医”1人，省级学术及技术带头人后备人选2人。目前有多人担任全国性杂志编委及SCI杂志审稿人，有5人担任各级学术团体的主委、副主委、委员和秘书等职务，形成一支技术力量雄厚，发展潜力巨大的眼科专科队伍。眼科拥有一流的眼科检查和治疗设备：歌德S4超乳玻切一体机2台、眼力健SignaturePro超声乳化仪2台、蔡司和徕卡手术显微镜系统5台、Stortz高清鼻内窥镜和泪道内窥镜系统。科医人多波长眼底激光、810激光、EllexUltraQReflex飞蚊症及前节激光、欧堡超广角眼底照相、海德堡OCT+OCTA+FFA+ICGA+炫彩成像系统、UBM、ECP、Pentacam角膜地形图、OQASTMⅡ视觉质量分析系统、IOLmaster生物测量仪、Humphrey自动视野计、德国罗兰视觉电生理检查仪、阿玛仕+达芬奇飞秒激光准分子手术设备等。眼科开展的诊疗项目广泛：有白内障超声乳化联合人工晶体植入术、飞秒激光及ICL等屈光手术、微创玻璃体切除术、视网膜脱离复位术、斜视弱视矫治、各种复杂青光眼的诊治、鼻内镜及泪道内窥镜手术、眼睑眼眶整复术、复杂眼外伤修复手术和其它眼表眼底疾病的综合治疗，其中斜弱视综合治疗、泪道内窥镜微创手术、高度近视后巩膜加固手术、难治性青光眼引流阀引流钉植入以及复杂眼外伤的修复手术等处于省内领先水平。眼科承担安徽医科大学眼视光医学专业的管理与教学，荣获多名校级和院级优秀教师。目前在研国家自然科学基金2项，第一作者/通讯作者发表SCI论文60篇。眼科将进一步加强与美国加州大学旧金山医学中心、上海交通大学医学院、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院、首都医科大学附属北京同仁医院和中山眼科中心等交流与合作，全面提升学科建设，促进医教研协同发展。亚专业分组：一病区（3号楼12层）：眼底病、眼外伤、白内障、葡萄膜及视路疾病。二病区（3号楼13层）：眼整形眼眶病、泪器病、斜弱视、青光眼、白内障、角膜病及眼表疾病。