湖州市中心医院儿科实行“大综合、小专科”战略，开设儿科24小时发热门诊、急诊及儿科、新生儿病房，拥有儿科医师27人，正高职称5人、副高职称9人。

开设儿童全科、呼吸、消化、神经、内分泌、行为心理评估、哮喘、特异性脱敏治疗各儿童亚专科专家门诊；拥有儿童长程视频脑电图、儿童呼吸睡眠监测仪、儿童电子支气管镜、儿童电子胃镜、有创呼吸机、双水平无创呼吸机、湿化高流量吸氧仪各2台、床旁B超、床旁心电图、床旁血气分析仪等医疗器械。

湖州市中心医院儿科为国家级住院医师规范化培训基地、温州医科大学、湖州师范学院医学院见习、实习基地；近5年省部级科研课题1项、市厅级科研课题3项；温州医科大学、湖州师范学院教学科研课题2项、近5年发表SCI论文3篇（2篇联合发表）、国内1级、2级杂志30余篇。