南方科技大学医院眼科，是集医疗、科研、教学于一体，技术力量雄厚、设备先进的临床诊疗科室。眼科分为门诊和病区，门诊位于门诊部3楼，设有眼科门诊室、验光室、治疗室、检查暗室、眼底激光造影室等。病区位于A栋4楼眼科肛肠科病区，年门诊量约3万余人次，设置床位20张，住院病人1000余人次。配置有S2000眼科手术显微镜、眼前段YAG激光机、NEDEK非接触眼压计、SHIN-NIPPON全自动验光仪、多功能裂隙灯显微镜、弱视治疗仪、YZ5T裂隙灯眼前段照相处理系统、荧光造影及532激光治疗仪、TOMMY角膜地形图、多功能视野计、光太眼AB超，综合验光仪等先进医疗设备。科室技术拥有人员共9名，包括专科医师6人，护士2名，技师1名。其中主任医师1名，主治医师4名、住院医师1名；博士1人，硕士4人、本科1人。申请广东省，深圳市级及区级课题4项，在国家级以上杂志发表论文20余篇（其中SCI两篇），专利1项，参编著作3部。诊疗服务项目白内障超声乳化及人工晶体植入术、各类青光眼滤过性手术、眼球穿通伤修补术、眼内异物取出术、玻璃体眼内注药术，显微镜下翼状胬肉切除联合羊膜移植术、泪囊鼻腔吻合术、泪道支架成形术，上睑下垂矫正术、斜视矫正手术、眼眶肿物摘除及眼部的整形等手术。开展眼前节照相，干眼症检测，静态视野计检查，眼底荧光造影及激光，屈光不正检影及斜视弱视的检查与治疗。