首都医科大学附属北京同仁医院亦庄院区普外科，诊治的疾病包括肝胆外科、消化道肿瘤外科、以甲状腺为主的普外科、以乳腺为主的普外科、血管外科、整形美容科及细胞移植实验室。每日完成大量医、教、研任务。总体水平达北京市先进水平，某些领域达北京市领先水平。肝胆外科是普外科重点科室。

首都医科大学附属北京同仁医院亦庄院区普外科广泛开展了微创手术，包括：腹腔镜胆囊切除手术、腹腔镜肝囊肿开窗术，胆总管结石十二指肠镜下括约肌切开取石术，大肠镜下息肉、肿物活检及切除术。

腹腔镜手术是现代科学和外科技术的完美结合，手术时外科医生只需在病人的腹壁上切开3－4个1厘米左右的微小切口，作为腹腔镜手术器械进入腹腔的通道，外接电视监视器，医生在电视监视下进行手术操作，手术视野清晰，术后伤口不用缝合。病人在术后1天就可下床活动、进食，3天就可出院，4周后可照常工作生活，伤口瘢痕小。

腹腔镜手术主要用于慢性腹痛。难以下决心是否手术的急腹症、腹部恶性肿瘤的分期等诊断和胆囊切除术，先天性肝囊肿开窗引流术、疝修补、阑尾切除术等治疗。