温州市中医院康复科是国家中管局的“十二五”重点专科，浙江省重点学科，国家中风后吞咽功能障碍康复诊疗方案协作组组长单位，国家康复住院医师规范化培训基地，温州市康复医学会会长单位，温州市康复医学质控中心挂靠单位，温州市康复医学专科联盟牵头单位。拥有(脑外伤康复、吞咽障碍康复、骨科康复、下尿道功能障碍康复、脊髓损伤康复等市级特色康复专科5个。目前分设五个病区，床位263张，科室拥有一支近200人的专业技术团队，高级职称9人，中级职称40余人，拥有温州市名中医1名，青年名中医2名，博士1人，硕士15人。总建筑面积约12000m2，集临床、科研、教学、医养结合为一体，服务功能全面，努力打造温州市中医院康复分院。以脑卒中康复、脑外伤康复、骨科康复、脊髓损伤康复、吞咽障碍康复、儿童康复、心肺康复等七大亚专科为学科发展方向。现代康复技术在处于国内先进水平，本科开展的常规现代技术有PT（3万多例次/年）、OT（2.2万多例次/年）、ST（2500多例次/年）、吞咽障碍评估与治疗（1.5万例次/年）、理疗（包括声、光、电磁）（3万例次/年）等，另外还开展了表面肌电图运动功能评估（2000多例次/年）、纤维鼻咽喉镜吞咽功能评估（230多例次/年）、电视透视吞咽功能评估（200多例次/年）、吞咽障碍球囊扩张治疗术（600多例次/年）、尿动力学检查（100多例次/年）、超声引导下肉毒素注射（200多例次/年）、高压氧舱治疗（1万例次/年）等。学科拥有纤维喉镜、尿动力检查仪、MOTOmed训练系统、LOKOhelp减重步行姿势训练系统、四肢联动、平衡评估与治疗仪、垂直律动、虚拟情景治疗系统、蹬踏系统、SMARK四件套、MJS上肢功能训练仪、冲击波治疗仪、步态分析仪、脉动治疗仪、盆底肌生物反馈治疗仪、心肺试验运动平台、吸气肌训练仪、语言功能检查成套测试表、认知功能训练电脑软件等先进康复设备。