医院成立于1949年，2013年通过二级甲等医院评审，2017年通过二级甲等综合医院复审，2019年顺利完成搬迁，2023年通过三级综合医院评审。医院新院区总投资9.8亿，占地面积267亩，总建筑面积17.5万平方米。现开放床位1350张，开设临床科室35个、护理单元35个，与上海、合肥、宿州、蚌埠、徐州等医院建立专科联盟38个，年收治住院患者5万余人次。现有在职员工1095人，副高及以上职称135人。现有常规CT，磁共振，乳腺钼靶、西门子平板胃肠及数台DR设备，1台美国进口GE128排CT。

2019年被授予“全国感控实践优秀基层医院”；2020年被授予“安徽省抗击新冠肺炎先进集体”、“安徽省感控之星先进集体”；2021年被授予“安徽省爱卫运动先进单位”、“安徽省健康促进医院”，同年1月安徽省卫健委批准同意我院设置为三级综合医院。2022年11月安徽省第二人民医院与灵璧县人民医院达成合作协议，挂牌为安徽省第二人民医院灵璧医院。

2023年获评：“安徽省健康服务业协会第二届常务理事单位(2023年—2028年)”“第五届中国县域医院优秀品牌建设奖”“安徽省医疗护理员试点医院”“宿州市巾帼建功先进集体”“安徽省定点医疗机构医保示范点”。2023年6月通过等级执业登记现场审查，挂牌“三级综合医院”。

在省卫健委的坚强领导和市县党委政府的关心支持下，安徽省第二人民医院灵璧医院将进一步提升医院办院水平，为灵璧人民带来更多健康福祉。办医者有激情，患者满意的人民卫健事业，努力将安徽省第二人民医院灵璧医院建设成集医疗、教学、科研、预防和康复为一体的省级区域医疗中心。