如皋市中医院建于1975年12月；1995年被评为国家二级甲等中医院；2010年建成南京中医药大学教学医院；2015年晋级三级乙等中医医院，同年成为南京中医药大学非直属附属医院（筹）;2020年再次通过三级乙等中医医院复评；2025年晋级三级甲等中医医院、南京中医药大学如皋医院，同年成为南京中医药大学临床专病研究院培育建设单位。

医院占地面积29132平方米，房屋总建筑面积83460平方米，医疗用房65880平方米，固定资产5.71亿元，设备总值(净值)1.62亿元，拥有万元以上设备1178台(套)。

医院编制床位1000张，开放床位765张，开设病区15个。设有临床一级科室20个，临床二级科室14个，医技辅助科室13个，其中全国农村医疗机构中医特色建设专科2个、江苏省中医重点专科3个、江苏省基层医疗机构中医特色建设专科1个、南通市中医重点专科9个、拥有全国名老中医药专家传承工作室基层工作站2个（刘沈林、李七一），全国基层名老中医药专家传承工作室1个，江苏省名中医工作室基层工作站1个，首都医科大学安贞医院吕树铮教授心脏介入工作站1个，上海东方肝胆医院张永杰教授外科工作站1个。2024年成为北京朝阳医院心血管专科联盟成员单位，与海军军医大学第三附属医院成立“肝胆专科联盟”。

职工总数808人，其中高级职称153，中级职称305名，博士研究生（在读）5名，硕士研究生103名。现有全国中医药各类人才8名、江苏省农村优秀中医临床人才4名、江苏省优秀人才培养对象2名，西学中优秀人才培养对象2名，南通市226高层次人才5名、医学重点人才1名、青年医学专家培育对象1名，如皋市第三期“148高层次人才梯队”培养对象4名。先后涌现江苏省名中医7名，南通市（基层）名中医11名，如皋市名中医8名。现有南通市百名中医师承指导老师5名，南京中医药大学兼职教师34名，南京中医药大学及扬州大学硕士研究生导师8名。

医院先后荣获江苏省文明单位、江苏省医保定点先进单位、江苏省卫生行风建设先进集体、江苏省老年友善医疗机构优秀单位、南通市廉政文化建设示范点、南通市十佳医院、南通市首批无红包医院、如皋市综合目标考核先进单位等荣誉。