慈溪市人民医院感染科位居门诊大楼西侧的一幢独立二层楼，一楼为门诊诊疗区，设有肝病专家、肝病专科门诊、肠道门诊、手足口病门诊、关爱门诊（HＩＶ门诊）、挂号收款处、药房、B超室、化验室、注射室、门诊留观室；二楼为住院病区，设床位41张。年门诊量近4万人次，年住院量1千余人次.科室消毒隔离设施齐全，设有二个通道（病人通道和医护人员通道）。环境优雅、诊区整洁。目前主要诊疗疾病有各种急慢性乙型病毒性肝炎、各种原因引起的肝损伤、肝硬化及其各种并发症、结核病、伤寒、流行性出血热、麻疹、水痘、各种痢疾、发热待查、感染性休克等一系列感染性疾病。科室以病人为中心，以医疗质量为核心，努力提高医疗水平，做到细致诚信服务。感染科是慈溪人民医院的重要科室，肩负着慈溪地区感染性疾病的预防、诊断、治疗的重任，是集临床、教学、科研为一体的综合性科室，目前还承担了温州医科大学本科学生的传染病学理论大课及临床实践任务，科室现有5名研究生，在省级以上医学杂志上发表临床研究论文20余篇。目前正在进行与药剂科合作的“脂肪肝中药治疗验方的制剂研发”课题项目，并在市科技局立项。目前拥有一支23名高素质医护人员组成的诊疗、护理队伍，其中包括主任医师2名，副主任医师3名，主治医师4名，住院医师5名，副主任护师2名，主管护师2名，护师4名，护士9名。门诊主要由具有临床经验丰富的主任医师及主治医师以上人员坐诊，病区分为3个诊疗小组，每一诊疗小组由相应的主任医师或副主任医师、主治医师、住院医师组成，由主任医师组织每周1-3次的三级查房、指导危重病人的抢救及疑难病例的讨论。2007年上半年开始，感染科与上海公共卫生临床中心结为合作单位，由上海公共卫生临床中心选派正高级专家来感染科进行业务指导及讲学。慢性乙型病毒肝炎的抗病毒治疗，及肝硬化及并发症诊治；及各种原因引起的肝功能损伤的诊治，各种发热原因的诊治，脂肪肝的中西医结合治疗。开展实验项目有乙型肝炎三个抗原体系统五项血清学指标检测；乙型肝炎HBV-DNA检测，乙型肝炎病毒基因分型及耐药检测；HBV-DNA低拷贝检测，甲、丙、丁、戊肝炎抗体检测；丙型肝炎HCV-RNA及自身免疫肝病抗体检测；肝脏活组织穿刺术等。2008年开始与上海公共卫生临床中心合作，每月派主任医师专家来慈溪市人民医院感染科座专家门诊、疑难病例会诊及学术讲座等。