上海健康医学院附属崇明医院中医内科是医院一级学科，系上海市中医药（临床类）重点学科，上海市治未病服务能力建设科室，上海市基层中医药实践推广培训基地，崇明区卫健委重点专科。目前下设中医内科，中医妇科，中医儿科，中医针灸科，中医治未病科5个二级学科。共有医护人员30名（含返聘），医生16人，护士14人。医生中主任医师1名，副主任医师6名，主治医生4名，住院医师5名。博士1名，硕士6名。开设有专家门诊，专科专病门诊及普通门诊，年门诊量8万余人次。拥有专科病床46张，年出院患者1500余人次。医疗特色科室以慢性支气管炎，哮喘的敷贴治疗，缺血性中风及其后遗症的中医综合治疗，肿瘤患者的中医药辅助治疗，慢性肾病的中西医结合治疗为主要特色。诊疗设备中医科拥有中医舌脉面信息采集仪，中医定向透药治疗仪，中医熏洗治疗仪，红外线治疗仪，灸疗仪等中医特色诊疗设备30余台。教学科研科室设有中医科教研室，多名医生取得全国高教资格证书，入选上海中医药大学“百师强基”教学老师库，承担崇明区中医师及全科中医学的教学和培训任务。科室近5年承担上海市卫健委，崇明区科委等科研项目10余项，5年发表学术论文20余篇，SCl论文4篇，参编专业著作4本，主编科普著作2本。