杭州市第一人民医院药学部，与医院同龄，创建于1923年，是集药事管理、临床药学、药学信息情报、院校教学、临床药理毒理与转化医学研究为一体的综合性药学部门。药学部坚持“以患者为中心”的服务宗旨，秉承以“保障患者安全、有效、经济、合理用药”为信念，积极拓展临床药学服务，积极打造医院安全用药网络。

药学部现有药学人员146名（包含已独立建科的中药房中药师21人），其中有主任药师7名、副主任药师9名、博士后4名、博士研究生14名、硕士研究生16名，药理学博导1名、中药学博导1名、药理学硕导6名、药物分析学硕导1名、中药学硕导1名，浙江省有突出贡献的中青年专家1人、浙江省卫生领军人才1人、浙江省卫生高层次创新人才1人、杭州市131人才1人。

药学部下设有药品调剂（门诊药房、急诊药房、静脉用药调配中心、病区药房与3个卫星药房等）、医院制剂室、临床药学科、临床药理研究室等多个部门。浙江省临床肿瘤药理与毒理学研究重点实验室、国家药物临床试验机构（GCP办公室）、Ⅰ期药物临床研究中心等研究平台挂靠药学部。