盐城市第三人民医院感染科，原名为传染科，与我院成立同步的科室之一，雏形于1950年10月。1953年成立，1983年独立设科，2008年改为感染性疾病科，现有专科高级医师4名，其中主任医师3名，副主任医师1名，有专科主任护师1名，主管护师2人。

感染性疾病在南、北两院各有一个发热门诊、肝炎门诊、肠道门诊，门诊采用整体统一管理、相对独立运营的模式、科室原有开放床位40余张，2016年始因三级甲等医院感控要求、设开放床位37张，2020年7月因拟可能紧急收治新冠肺炎病房感控设置的政治要求，设规范化床位27张，发热门诊独立设置，由院部直接管辖。

我科在常见、重大传染性疾病的诊断治疗、规培带教、临床教学、科研工作、人才培养和学科建设等方面取得了显着成绩。学科以各类肝病（病毒性肝炎、肝硬化、脂肪肝、药物性肝炎、自身免疫性肝炎）和感染性疾病的诊治为特色，并选择病毒性肝炎的治疗作为主要发展方向，围绕慢性病毒性肝炎的特异性细胞生物治疗、建立重型肝炎的新型综合疗法和研究开发慢性乙型肝炎的治疗方法为目标，多年来，重症肾综合征出血热、血吸虫病、恙虫病和肠道传染病尤其是烈性肠道传染病—霍乱的诊治方面及各种传染性疾病的救治等方面积累了丰富的经验，适时适宜诊治发热待查、腹泻待查及黄疸待查等感染相关性疾病，合作性肝癌的介入治疗、脾栓塞治疗脾亢、肝癌和肝转移癌的放疗、肝硬化门脉高压症预防出血及止血治疗等。

有一定的学术地位，盐城市医学会感染病学分会副主任委员1名、盐城市医学会感染病学分会委员3名，江苏省医学会感染病学分会委员1名，江苏省学分感染病学分会肝病学组委员1名，江苏省中西医结合学会感染病专业委员会委员1名，江苏省医院协会传染病医院分会委员会委员1名。