首都医科大学附属北京中医医院肛肠科，是建院即建科，拥有63年历史的老牌科室，是拥有独立病区、目前病床26张的临床科室，是北京市级中医重点专科。本科年门诊量15000余人次；有慢性便秘、慢性泄泻、复杂肛瘘、混合痔、肛裂等专病专台；病房年收治患者800余人，手术700余人次；可以开展痔疮、肛瘘、肛周脓肿、肛裂、直肠息肉、肛管直肠狭窄、直肠粘膜脱垂、排便障碍性便秘（直肠前突、耻骨直肠肌痉挛）、结直肠癌等良性及恶性疾病的手术，特别是中西医结合、内外科结合、全身与局部结合治疗慢性泄泻（炎性肠病——溃疡性结肠炎、克罗恩病）、慢性便秘突显现代中医院肛肠专科的特色。拥有国家级名老中医、首都国医名师王嘉麟老中医传承团队，是北京市薪火传承“3+3”王嘉麟名家研究室所在单位，努力传承名老中医经验，传统与现代治疗理念相结合，努力为广大患者解除病痛。近年引进了电子乙状结肠镜、肛管直肠压力检测仪、远红外线治疗仪、激光治疗仪、高频电刀、Ligasure及结肠灌洗治疗机等现代化治疗、检测设备，充分发挥中西医结合优势，形成了一整套独具特色的诊疗方法。

肛肠科是手术科室，在保留传统疗法中科学、有效部分如挂线疗法、消痔灵注射固脱疗法等的同时，结合现代医学的先进之处，相继开展了Ligasure痔切除术、针状电刀痔手术、RPH术、直肠癌根治术等新技术及高难手术，今后将继续开展新技术和高难手术，形成肛肠科自有的手术模式。特别体现在手术患者的治疗过程中，如长效麻药的固定配比，使得肛肠手术不再是“疼痛的手术”。肛肠科是特别能体现中医特色的科室，而中医药治疗肛肠病历史悠久，疗效显著。我科运用中医药手段特色诊疗便秘、炎性肠病，术后“肛肠1号方”的常规使用较好的解决了术后排便困难、排便疼痛等难题，由此缩短了伤口愈合时间，减少了患者住院时间，术后局部换药使用我科院内制剂：痔疮洗剂及肛肠熏洗方清热利湿、疗创止痛，痔科止血散止血，红纱条和烫伤一号纱条去腐生肌，体现出了中医药治疗肛肠疾病的方法、手段、药物的多样性。