首都医科大学附属北京中医医院针灸科（针灸中心）成立于1956年，汇集了有“南陆北王”之称的金针王乐亭、创立“针灸三通法”的首届国医大师、人类非物质文化遗产中医针灸代表性传承人贺普仁、擅治疼痛的夏寿人、对循经感传研究有开创性贡献的于书庄等一批在全国具有学术影响力的针灸大家，学术底蕴深厚。至今已发展成为国家临床重点专科、国家中医药中医针灸重点专科、国家中医药管理局重点学科、北京市医管局“扬帆”计划重点医学专业、北京市国家中医重点专科辐射工程——首都核心专科（X）、北京市中医针灸特色诊疗中心、北京针灸学会会长单位。拥有针灸神经调控北京市重点实验室、国家中医药管理局“贺普仁国医大师工作室”、北京中医药“薪火传承3+3工程”-贺氏三通法工作室和国家中医药管理局“周德安名医传承工作室”。目前医生团队共47人，其中博士18人，硕士21人，硕士以上比例83%；高级技术职称27人，所占比例57%；博士生导师1人，硕士生导师5人。拥有国医大师1人，首都国医名师1人，中国针灸学会副会长1人，全国老中医药专家学术继承人8人，全国优秀中医临床人才5人，中国科协青年托举人才1人，北京市“十百千”卫生人才1人，北京市科技新星1人，市卫生系统高层次卫生技术人才学科骨干2人，北京市医管局“青苗计划”获得者3人。住院部共有脑血管病、神经系统疑难病和康复三个病区，开放床位116张，病床使用率超过100%，年收治2900余人次，近年来DRGs绩效评价在北京市三甲中医院中连续位居第一。建立了全天候的脑血管病急性期绿色通道，开展了脑梗死急性期静脉溶栓、动脉溶栓及机械取栓到恢复期康复的集重症监护抢救、针灸中药治疗、PT/OT康复、语言训练、吞咽训练、肉毒素注射等为一体的全程诊疗。对于神经系统疾病广泛开展腰椎穿刺、肌电图、脑电图、肌肉活检、神经活检等先进诊断方法。针灸门诊面积950平方米，治疗床位78张，年门诊量12万人，开设了头面痛、失眠、耳聋耳鸣病、中风病、下肢静脉曲张、皮肤病、月经病、卵巢功能减退等专病、专症门诊，特色优势突出。针灸科具有广泛的学术影响力。创立了贺氏针灸三通法理论体系，为当代针灸治疗学做出突出贡献，并据此制定了火针国家标准。拥有贺氏火针疗法、中风十三治、金针透刺等多项独具特色的专科技术。作为国家中医药管理局中风病协作组组长单位之一，将“中风十三治”与“贺氏针灸三通法治疗中风病技术”融入中风病针灸诊疗方案在全国推广应用，并作为北京市科委“首都十大危险疾病科技成果推广专项”之中唯一的中医项目—“脑血管病恢复期针灸治疗规范与路径的推广应用项目”在北京地区推广应用。专科依托北京针灸学会平台、北京市中医管理局1+X+N工程积极促进专科协同发展，发挥示范、带动和辐射作用，形成上下联动、管理高效、专业能力突出、品牌知名度高的北京地区针灸专科联盟。十二五以来，科室共承担包括国家973计划、国家自然科学基金等课题53项，总经费达2012.97万元；发表国内核心期刊文章278篇，SCI/EI收录文章80篇，累计影响因子152.85，其中影响因子大于5的论文6篇；发表论著共9部；编写全国中医药行业高等教育“十三五”规划等教材5部；发布国家中医药管理局中医团体标准4项；获得省部级等科技成果奖6项；获批专利7项。