北京医院眼科是具有国内一流技术水平、先进设备和优良服务的现代化科室。曾经担任该科室带头人的有我国现代眼科界创始人之一的著名眼科专家罗宗贤教授和德高望重的眼科专家左克明教授。历任各届科室主任的还有张尧贞、周佩瑢、刘云、高岩、关航、戴虹等。现任科副主任为王铮（主持工作）、喻晓兵、李晓宇。

眼科现有专业人员40余人，其中教授、主任医师8人，副教授、副主任医师9人，其中多人先后在美国、德国、加拿大、日本、香港等眼科学术机构进行长期的学术研修学习，为科内技术学科的发展奠定了深厚的基础。

眼科设有8个专业组，分别为眼底病组、白内障组、青光眼组、屈光和眼肌组、角膜病组、老年眼肌疾病组、泪道疾病组和神经眼科组，开展玻璃体视网膜、眼外伤、白内障、青光眼、斜视矫正、角膜移植、眼部整形等各类手术。

北京医院眼科具有国内先进的检查仪器和医疗设备，充分保证了医疗工作的完成和科研工作的开展。多年以来，北京医院眼科形成了以老年眼病诊治为特色的发展方向，擅长黄斑病变（老年黄斑变性、各类新生血管病变、黄斑裂孔和黄斑前膜等）、老年性白内障、青光眼、老年视光学、老年眼肌等疾病的诊断治疗。在国内率先开展了多项治疗老年黄斑变性的新方法。同时开展各种眼科常见病、多发病的诊治，包括角膜疾病、青光眼，各种眼底病，眼肌、屈光类疾病，泪道疾病等，特别是在高龄患者的手术、治疗方面积累了丰富的经验。

北京医院眼科年门诊量8万余人、手术1万余人次，是北京市住院医师培训基地，北京大学眼科学教学单位，承担北京大学医学部和北京协和医学院研究生培养工作，是香港理工大学视光学系教学基地。并负责中国医科大学、山东大学等多所医科院校的学生教学任务。