徐州市儿童医院新生儿科是徐州市及淮海经济区域内一支小儿外科专业队伍，是江苏省省级重点专科，在先天性食管闭锁、先天性肥厚性幽门狭窄、十二指肠梗阻性疾病及其它消化道畸形、先天性巨结肠、先天性肛门闭锁、先天性腹裂、先天性脐膨出、骶尾部畸胎瘤等有专业性技术优势和特色。
曾多次获得省卫生厅新技术引进奖、徐州市科技进步奖，先进的设备、过硬的技术和舒适的就医环境、温馨的服务态度为徐州市儿童医院新生儿外科赢得诸多赞誉。
新生儿科开放床位40张，10个抢救单元，现专业医师13名，主任医师1名，副主任医师3名，主治医师4名，住院医师5名。博士1名，在读博士1名，硕士6名。医护人员高、中、初级人才结构合理。
科室主要收治小儿外科各类疾病：
1、先天性食管闭锁;
2、先天性食管裂孔疝、膈疝;
3、先天性胃壁肌层缺损;
4、十二指肠梗阳性疾病：十二指肠闭锁、狭窄、环状胰腺等;
5、先天性肠旋转不良、中肠扭转;
6、先天性肠闭锁;
7、先天性巨结肠;
8、先天性肛门闭锁;
9、骶尾部畸胎瘤;
10、先天性膜裂、脐膨出;
11、先天性肥厚性幽门狭窄;
12、新生儿头皮血肿;
13、婴幼儿体表包块;
14、腹部肿瘤;
15、小儿便秘;
16、卵巢囊肿。