新疆生产建设兵团总医院泌尿外科是医院重点发展科室，现有医护人员23人，硕士生导师4人。医师10人，技师一人，护士14人，正高职称3人，副高职称3人，主治医师2人，住院医师3人，现有硕士生6人，在读博士1人。三个亚专业组，分别为肿瘤组、结石组、男科组。内腔镜、腹腔镜等微创技术处于全国先进、疆内领先水平。拥有尿动力检测仪、等离子电切镜、输尿管软/硬镜、经皮肾镜、EMS五代超声负压碎石机、科医人P100大功率钬激光治疗系统、绿激光前列腺治疗系统、电子3D腹腔镜、双定位体外冲击波碎石机、生物反馈电刺激治疗仪等国际先进设备。

科室在疆内率先开展了前列腺微创切除术（等离子电切术/绿激光汽化切除术）、腹腔镜下泌尿系肿瘤的切除术，包括根治性前列腺切除术、根治性全膀胱切除术、肾上腺肿瘤切除术、根治性肾切除术、半尿路切除术（治疗肾盂癌）、肾部分切除术、肾盂输尿管整形术等，采用国际先进的微创技术治疗泌尿系各部位结石，尿道狭窄等疾病、微创TVT-O治疗女性压力性尿失禁。男科方面：腹腔镜下精索静脉曲张高位结扎术，隐匿性阴茎整形术，阴茎短小延长术，输精管结扎术等。