昆明市儿童医院泌尿外科是云南省最早成立的小儿特色专科之一，是省内规模的儿童泌尿系统疾病诊疗中心，是云南省及昆明市重点学科（小儿外科），也是云南省小儿外科住院医师规范化培训基地。担负着全省儿童泌尿外科疾病的诊断、治疗任务，同时接诊周边省份及邻近国家的泌尿系统疾病患儿。科室专业队伍技术力量雄厚，目前科室有副主任医师1名，主治医师2名，住院医师数名，专科护理团队15人，其中硕士3人。科室拥有德国WOLF全套小儿膀胱输尿管镜、高清成像摄像系统及腹腔镜等先进的硬件设施。科室现有床位38张，年住院手术1800余台，年门诊诊疗18000余人次。腹腔镜等先进的硬件设施。科室现有床位38张，年住院手术1800余台，年门诊诊疗18000余人次。经过多年的学科发展和经验积累，泌尿外科能诊治各种小儿泌尿系统疾病，擅长治疗各种小儿先天性泌尿系统畸形及疾病，对先天性尿道下裂、先天性肾积水、肾囊肿、肾母细胞瘤、先天性泌尿系统重复畸形、膀胱输尿管反流等的治疗技术已达到国内先进水平。尤其对先天性尿道下裂，根据病情不同采用相应最合适的手术方式，一期手术修复成功率达85%，且外形美观，达到国内先进水平，能够极大的改善患儿今后的生活质量。采用小切口肾盂输尿管离断吻合术治疗肾积水，手术切口仅2厘米左右，具有出血少、创伤小、患儿痛苦少、术后恢复快等优点。科室采用膀胱镜微创技术对多种疾病进行手术，极大的减轻了患儿的创伤和痛苦。泌尿外科率先在国际上采用先进的内置式商环包皮环切术，以手术时间短，患儿痛苦小，术后切缘整齐美观，安全可靠等优点得到国内外泌尿外科起专家的肯定，独立完成的儿童青少年包皮环切手术视频荣获国际生殖医学联盟（IFFS）和美国生殖医学会（ASRM）联合会议2013年度技术成就一等奖，目前该技术在比尔及梅琳达盖茨基金会的推动下，在国际上推广。采用化疗—手术—化疗等一系列综合治疗肾母细胞瘤，加强了对肿瘤晚期病人术前和术后的规范性化疗，术中根治性切除肿瘤，使患儿长期存活率达到80%以上。泌尿外科注重开展国内外学术交流，是省内各县区泌尿专科医师的重要培训基地，全面优质护理示范病区。目前已在国内核心期刊发表论文数十篇。