宝鸡市中心医院血液风湿免疫科组建于1999年，是全市第一个成立的该领域专业科室，学术水平在全市处于领先地位，是宝鸡市优势学科。开放床位90张，有血细胞分离机2台、血液净化仪及先进的百级无菌层流移植病房。现有人员34人，其中主任医师1名，副主任医师6名，副主任护师1名。

血液病方面主要诊治白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征、血小板减少性紫癜、多发性骨髓瘤、淋巴瘤、过敏性紫癜、血友病、溶血性贫血、阵发性睡眠型血红蛋白尿、骨髓纤维化等疾病。

风湿病方面主要诊治危重症系统性红斑狼疮、干燥综合征、系统性硬化症、皮肌炎、混合结缔组织病、类风湿关节炎、骨关节炎、痛风等疾病。

科室能开展自体造血干细胞移植、异基因造血干细胞移植、血细胞分离单采、血液免疫净化、间充质干细胞、云克治疗炎性关节病、介入下自体外周血造血干细胞治疗早期股骨头坏死、肝硬化等特色治疗项目。