南通市第一人民医院耳鼻喉科为市级临床重点专科，常规开展鼓室成形术、耳内镜手术、功能性鼻内镜鼻窦手术、鼻内镜下中隔矫正术、等离子扁桃体及腺样体切除术、支撑喉镜下CO2激光手术、改良腭咽成形术、全喉切除术、半喉切除术及气管切开术、变应性鼻炎脱敏治疗、耳廓畸形矫正。

耳鼻喉科拥有的先进设备包括：贝多芬CO2激光、CarlZeiss显微镜、高清超细OLYMPUS电子鼻咽喉镜、低温等离子射频手术系统、STORZ内镜系统、SONY显示器、纯音测听仪、耳声发射仪、听性脑干测试仪、耳鸣治疗仪。

近年来，科室共获省卫生厅科技一等奖，市科技进步二等奖，省、市新技术引进奖四项，省市级科研课题13项，专利30余项，发表SCI论文4篇，中华级学术论文10余篇，统计源期刊论文百余篇。每年举办市医学继续教育培训项目。

科室是国家级住院医师规范化培训基地，承担南京医科大学、南通大学医学院本科理论教学及临床带教任务。